石山書院的命名取自於石頭山的寓言故事，講述一個村落裡的人們得了怪病，需要到石頭山頂取得靈藥才能治病。但攀爬石頭山的過程困難、險峻，若人們萌生放棄的想法而回頭，就會變成石頭山上的一顆石頭。最終，村人們憑著互信、互望、互愛，成功抵達石頭山頂取得解藥，社群間充滿溫暖、喜悅的氛圍。